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華為云服務(wù)面向生物科學(xué)領(lǐng)域進(jìn)行定制開發(fā)

--李亦學(xué):生命科學(xué)面臨從實(shí)驗(yàn)驅(qū)動(dòng)向大數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)轉(zhuǎn)型

2014-07-30 12:24:49   作者:   來源:CTI論壇   評(píng)論:0  點(diǎn)擊:


  生命科學(xué)領(lǐng)域的大數(shù)據(jù)時(shí)代已然到來。據(jù)相關(guān)統(tǒng)計(jì),全球每年生物數(shù)據(jù)總量已經(jīng)達(dá)到EB量級(jí),完整的人體基因組有約30億個(gè)堿基對(duì),個(gè)體化基因組差異達(dá)6百萬堿基,基于個(gè)性化的遺傳背景產(chǎn)生了巨大數(shù)據(jù)。如果能高效、高速地利用這些大數(shù)據(jù),無疑將為生命科學(xué)行業(yè)帶來無限機(jī)遇。

  在不久前由生物谷和華為云服務(wù)聯(lián)合主辦的云服務(wù)與大數(shù)據(jù)知識(shí)分享沙龍活動(dòng)中,演講嘉賓李亦學(xué)教授指出,生命科學(xué)正面臨從實(shí)驗(yàn)驅(qū)動(dòng)向數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的轉(zhuǎn)型局面,海量的數(shù)據(jù)將成為生命科學(xué)的基礎(chǔ),云服務(wù)、大數(shù)據(jù)等相關(guān)技術(shù)將成為轉(zhuǎn)型重要因素。

  李亦學(xué)認(rèn)為,急劇增加的生物數(shù)據(jù)和計(jì)算機(jī)能力間的巨大差距是大數(shù)據(jù)發(fā)展面臨的首要問題。”放眼國(guó)內(nèi)生物科學(xué)院,其在運(yùn)用現(xiàn)有IT技術(shù)處理大數(shù)據(jù)方面無不面臨著部署慢、存儲(chǔ)容量小、成本高等困境。

  生物科學(xué)高性能計(jì)算需要海量的計(jì)算資源,且計(jì)算擴(kuò)容速度很快,資源的部署周期長(zhǎng)。傳統(tǒng)IT服務(wù),從設(shè)備采購到安裝調(diào)試,需要數(shù)月的時(shí)間,難以及時(shí)響應(yīng)業(yè)務(wù)的變化;同時(shí),生科計(jì)算往往比較復(fù)雜,傳統(tǒng)生命科學(xué)計(jì)算依靠手工進(jìn)行環(huán)境部署,耗時(shí)耗力,效率低下;除此之外,生科計(jì)算產(chǎn)生海量數(shù)據(jù),對(duì)存儲(chǔ)有高要求,由于存儲(chǔ)能力不足,導(dǎo)致數(shù)據(jù)人工逐行刪除;對(duì)于生科企業(yè)來說,自建高性能計(jì)算平臺(tái)一次需耗費(fèi)大量資金,且設(shè)備更新?lián)Q代成本高,可能導(dǎo)致面臨資金不足風(fēng)險(xiǎn)等。面對(duì)這些問題傳統(tǒng)的IT技術(shù)已經(jīng)顯露出它的弊端,亟需尋找傳統(tǒng)IT的替代。

  針對(duì)高速有效地分析生物大數(shù)據(jù)所需要的技術(shù), 李亦學(xué)認(rèn)為云服務(wù)或可提供解決有力支撐。

  云服務(wù)具備彈性、快速擴(kuò)展、即租即用等特征,可向用戶提供彈性海量的計(jì)算、存儲(chǔ)資源,輕松應(yīng)對(duì)大規(guī)模計(jì)算處理,幫助用戶快速部署和管理大規(guī)模可擴(kuò)展的IT基礎(chǔ)設(shè)施資源。而在生物科學(xué)領(lǐng)域,國(guó)內(nèi)領(lǐng)先的云服務(wù)商華為云已經(jīng)有一整套成熟完整的解決方案。

  華為云服務(wù)能夠?yàn)榛蚬こ、蛋白質(zhì)工程、生物制藥等需要高性能計(jì)算的業(yè)務(wù)提供海量并行計(jì)算資源,以及提供包括云主機(jī)、云硬盤、對(duì)象存儲(chǔ)服務(wù)、線下傳輸服務(wù)等在內(nèi)的高性能云服務(wù)。華為生科云解決方案是一套基于行業(yè)特性、工作流程、業(yè)務(wù)分析流程的需求,整合強(qiáng)大的計(jì)算能力、存儲(chǔ)能力,為用戶提供超算、數(shù)據(jù)存儲(chǔ)等多種服務(wù)的云計(jì)算服務(wù)平臺(tái),且操作簡(jiǎn)單、靈活多樣。“華為云服務(wù)面向生物科學(xué)領(lǐng)域進(jìn)行的定制開發(fā),運(yùn)營(yíng)模式設(shè)計(jì),支撐服務(wù)方面的能力令人印象深刻。”上海生命科學(xué)院相關(guān)負(fù)責(zé)人表示。

  華為生科云解決方案由分布式計(jì)算引擎、彈性計(jì)算云、對(duì)象云存儲(chǔ)、線下大數(shù)據(jù)傳輸服務(wù)四部分組成,為客戶提供端到端的解決方案。其中分布式計(jì)算引擎所需的行業(yè)模版由客戶自定義或者使用合作伙伴提供的預(yù)定義行業(yè)模版,華為負(fù)責(zé)提供計(jì)算和存儲(chǔ)資源,以及調(diào)度能力。

  華為云服務(wù)相關(guān)負(fù)責(zé)人介紹:分布式計(jì)算引擎能夠通過用戶定義的業(yè)務(wù)流程,把多步驟的復(fù)雜運(yùn)算過程固化下來,簡(jiǎn)化運(yùn)算過程,提高計(jì)算效率,運(yùn)算過程由分布式計(jì)算引擎進(jìn)行判斷和驅(qū)動(dòng),不需要人工干預(yù),實(shí)現(xiàn)計(jì)算的自動(dòng)化和流程化。這正好與目前生物科學(xué)大數(shù)據(jù)所需要的復(fù)雜業(yè)務(wù)需求相匹配。

  另外,由分布式計(jì)算引擎負(fù)責(zé)部署計(jì)算環(huán)境,提高環(huán)境部署效率,降低部署復(fù)雜度;整個(gè)業(yè)務(wù)過程以流程圖的形式進(jìn)行直觀展示,讓業(yè)務(wù)過程一目了然;在計(jì)算完成或者出現(xiàn)異常情況,會(huì)自動(dòng)提示操作用戶,進(jìn)行人工干預(yù)或者修正。

  最后,分布式計(jì)算引擎可以對(duì)資源池里的資源進(jìn)行有效管理,自動(dòng)投放任務(wù)到空閑節(jié)點(diǎn);可根據(jù)業(yè)務(wù)需要對(duì)資源池里的節(jié)點(diǎn)資源進(jìn)行增加或者刪除,實(shí)現(xiàn)按需使用,按需付費(fèi)。

  這些都是分布式計(jì)算引擎受到客戶青睞的重要因素。

  除此之外,華為云服務(wù)具有中立、安全、高可靠、低成本的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)能力,來滿足用戶的原始數(shù)據(jù)和計(jì)算結(jié)果的存儲(chǔ)需求;在商業(yè)模式上,可按需使用、按需付費(fèi)、即租即用的方式,縮短IT建設(shè)周期,降低初始投資成本,減輕企業(yè)后期運(yùn)維成本。

  隨著基因測(cè)序成本等的急劇下降,數(shù)字與生物科學(xué)高度融合,大數(shù)據(jù)背景下的云服務(wù)將超越提升效率和降低成本的支撐地位,成為生物科學(xué)創(chuàng)新的核心競(jìng)爭(zhēng)力并將重新定義市場(chǎng)的制高點(diǎn)。 對(duì)生科企業(yè)及研究院所來說,在華為公有云平臺(tái)上測(cè)試和構(gòu)建自己的業(yè)務(wù)模式將是一種經(jīng)濟(jì)高效的方式, 基于華為云服務(wù)平臺(tái)的生物行業(yè)服務(wù)范式將被全新構(gòu)建。

  正如李亦學(xué)教授所說,生命科學(xué)正面臨從實(shí)驗(yàn)驅(qū)動(dòng)向數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)轉(zhuǎn)型。誰先掌握了技術(shù)誰就掌握了生命科學(xué)的命脈。云服務(wù)無疑是生命科學(xué)從實(shí)驗(yàn)驅(qū)動(dòng)向數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)轉(zhuǎn)型的重要驅(qū)動(dòng)因素。

  關(guān)于華為云服務(wù)

  華為生科云解決方案,由分布式計(jì)算引擎、彈性計(jì)算云、對(duì)象云存儲(chǔ)、線下大數(shù)據(jù)傳輸服務(wù)四部分組成,為客戶提供端到端的解決方案。其中分布式計(jì)算引擎所需的行業(yè)模版由客戶自定義或者使用合作伙伴提供的預(yù)定義行業(yè)模版;華為負(fù)責(zé)提供計(jì)算和存儲(chǔ)資源,以及調(diào)度能力。

  關(guān)于李亦學(xué)

  李亦學(xué),博士,研究員,博士生導(dǎo)師。上海生物信息技術(shù)研究中心主任,中科院上海生命科學(xué)研究院生物信息中心主任, 中科院系統(tǒng)生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任,國(guó)家“十一五”863計(jì)劃生物與醫(yī)藥領(lǐng)域?qū)<医M成員。2003年上海市勞動(dòng)模范,2003年度上海市優(yōu)秀學(xué)科帶頭人,F(xiàn)為國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)生命科學(xué)部自然科學(xué)基金評(píng)審專家,德國(guó)Journal of Integrative Bioinformatics雜志,美國(guó)Medical Science Monitor雜志特邀審稿人,國(guó)內(nèi)《科學(xué)通報(bào)》特邀編輯,生物物理和生物化學(xué)學(xué)報(bào)、中國(guó)生物工程雜志以及Genomics,Proteomics and Bioinformatics 等雜志編委。

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